新冠肺炎疫情發生以來，長江流域內湖北等重要省，武漢等沿江重要城市疫情防控形勢嚴峻。為堅決打贏新型冠狀病毒感染的肺炎疫情防控阻擊戰，進一步做好疫情防控期間水利重點領域保障工作，長江委節約保護局按照水利部關于加強疫情防控期間水利保障工作的緊急通知精神，貫徹落實長江委黨組“一手抓防疫，一手抓生產”工作部署，積極組織長江委水文局、南水北調中線水源公司等單位及時開展丹江口水庫等重要水體和長江中下游水質監測儀監測工作，要求各水文站做好水體異常現象和突發水污染事件觀測工作。
防疫期間，為加強流域突發水污染事件管理，節約保護局組織水文局、中線水源公司在保證防疫安全的前提下，組織做好流域長江干流沿線及陶岔渠首等重要水體觀測，通過建立微信群的方式，于每日17時前報告流域突發水污染事件狀況和南水北調中線取水口水質情況，經匯總分析后報水利部。截至2月23日，長江流域未發現水體異常現象，也未發現重大水污染事件，南水北調中線水源水質良好(陶岔渠首高錳酸鹽指數、氨氮、總磷等均為I類，總氮保持穩定)。
疫情當前，為保證掌握長江中下游沿線飲用水水源水質狀況、南水北調中線水源水質狀況，以及長江武漢江段帶菌廢水及消毒液等污染水體的潛在風險，水文局、中線水源公司克服疫情防控期間感染風險較大、出行不便等困難，在做好自身防護的基礎上，開展武漢、南京、九江等城市江段、丹江口水庫水源地等全國重要飲用水水源地等重要水體水質監測工作，以及武漢江段余氯監測，監測成果經分析整理后已報送水利部和長江干流沿線城市水利局。
